對房地產進行價值評估是開征房地產稅的前提，但目前各方對評估主體的確立還有不同意見。從全國多地來看，房地產批量評估技術已經較好地運用到契稅征管當中。
在評估機構設置上，大部分地區是地稅部門負責評估，將數據調查、模型建立、系統開放等工作外包給專業公司。成立獨立的法定機構專門負責評估的，只有深圳。
對此林家彬認為，不管是稅務部門、建設部系統還是第三方評估，評估后納稅人如果有異議如何處理，這個機制的建立更為關鍵。從很多發達國家的經驗來看，以征稅為目的的房產評估值一般都低于市場價值。
即使是獨立評估機構對房地產做出的科學評估，仍然可能與房地產的實際價值產生偏離，與納稅人的預期也常常出現差異。因此公正透明的爭議解決機制，是保證房產稅順利征收的必要配套制度。
滿燕云認為，本著漸進式推進的原則，可以先對工商業等已經征收房產稅的房地產類型按照評估價值征稅，再逐步推進到個人住房。而且有必要適時出臺房產稅評估法，做到有法可依。
賈康表示，個人住房房產稅改革的發展方向肯定是按照評估值征稅，而且各地目前已經引進了稅基評估的基本概念，評估技術也會越來越完善。對于稅基爭議的處理，國際通行的慣例是建立仲裁機制。
試點下一步
日前，央行研究局等有關部門的學者共同完成了一份關于土地制度改革的報告，報告提出房產稅的征收建議。
房產稅可選擇兩條改革路徑。一是新老劃斷，只對新購房產征稅。此方案法律風險較低，實施阻力較小，但可能保護既得利益者，也可能導致市場分割。二是對存量、增量房產統一征收房產稅。存量房產由此可能大量進入二級市場進行交易，有利于調控房價，也有利于防止市場分割。
報告提出，目前征收房產稅的時機已經成熟，改革試點要盡快擴大。另外，近三年內應該盡快推行的稅制改革中，應該包括房產稅。目前可以考慮允許不同地方選擇不同的方案進行試點，實踐中慢慢積累經驗，總結教訓，逐步優化趨同。
“上海、重慶的試點方案不具有推廣意義，接下來如果只是一個一個地區擴大試點，意義不大。”在林家彬看來，推動房產稅制改革更有利的方式是對目前房地產稅費進行整合，在保持整體稅負水平大體不變的前提下，推出新型的房地產稅制整體框架。
他還建議，應改變目前房地產稅種繁多、收費名目繁多的狀況，建立起稅種精干、政策目標與調控對象明確的房地產稅制體系，同時降低流通環節稅負。保有環節房產稅方面，應該設計統一的稅率范圍，允許地方政府在此范圍內自行選擇。
但賈康表示，考慮房產稅改革面臨的阻力，需要先行先試，通過增加試點逐漸突破，不能一下全面鋪開。
為更好地推行這項改革，林家彬建議進行大規模的宣傳，讓納稅人明白，并不是通過改革增加整體的稅負，而是要在整體稅負水平不變的前提下，改革房地產稅制。而且，房產稅的主要納稅人應該是高收入者，滿足基本居住需求的部分人不需要繳稅或只需繳很少的稅。
目前上海、重慶兩地均是以地方通知的形式在做房產稅試點，林家彬認為接下來有必要修訂相關法律法規，或者出臺新的房產稅條例。
接近財政部的相關人士表示，接下來的房產稅改革，需要把握好幾個方面。
在穩步擴大試點的同時啟動立法程序。要穩步擴大試點，如果沒有后續省市的跟進，不僅上海、重慶兩地繼續推動改革的壓力加大，而且不利于形成群體效應；另一方面，力求試點政策的多樣性，只有試行多樣性的政策，才能發現各種問題，選擇最優方案。試點的同時全國人大應啟動立法程序，制定房產稅法。