沈至入獄的原因是逃避賦役，沈莊入獄則可能是涉嫌“胡黨”、逃避賦役而羈押至京，其事不小，連補帶罰，再加上兩兄弟最終都能出獄的上下打點，其數目也定在巨萬以上。
大約在同年，沈萬三的女婿陸仲和卻在劫難逃，被扣上“胡黨”的罪名滿門抄斬。
第三次打擊是在明洪武三十一年(1398)。
洪武二十六年(1393)，“藍黨”案發，藍玉被處死，株連則在全國蔓延。有一位叫王行的先生，曾兩次在沈家坐館，同沈家至少有三十年的交情，又兩次在藍玉家坐館，前后也有十多年之久。通過王行的關系，想在新朝找到靠山的沈家同藍家也有了交往。“藍黨”案發后，有人勸王行逃遁，這位迂腐先生說：“臨難無茍免。”結果以同謀罪被誅。
當時，沈萬三女婿顧學文因奪人之婦，仇家懷恨在心，藍玉事發后，仇家即以沈家同藍家的關系為據，誣告顧學文與藍玉通謀。在嚴刑逼供下，顧學文招認曾收到藍玉“鈔一萬五千貫”，為他購置糧米、綢緞等物，用來準備起事和賞人。
《弘治吳江志》載：案情牽涉他的“妻族沈旺、沈德全、沈昌年、沈文規、沈文矩、沈文衡、沈文學、沈文載、沈海，凡八人。”其中沈旺是沈萬三的兒子，其他人等也都是沈萬三的子孫。《周莊鎮志卷六·雜記》記：“洪武三十一年二月學文坐胡藍黨禍，連萬三曾孫(沈)德全六人，并顧氏一門同日凌遲。”同日被殺的還有八十多人。
《乾隆吳江縣志·舊事》載有胡藍黨犯人沈德全一家的處置細節：二月十八日載：“正黨與戶下戶丁多著折了臂膊，未出動的小廝不打，且牢著他。供出的田口家財斷沒了。”二月二十日載：“正黨與戶下戶丁都凌遲了，十歲以上的小廝都發南丹衛充軍，十歲以下的送牧馬所寄養，母隨住；一歲至三歲的隨母送浣衣局，待七歲送出來。”——真可謂慘不忍睹！
沈萬三苦心經營的巨大家業，就這樣急劇地衰落了。（新華網）